Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCBQ16585 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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