Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN9AQ15858 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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