Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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