Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A1Q15459 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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