Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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SEC23BQ15437 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC23BQ15437 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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