Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TLR1Q15399 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms