Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCF4Q15080 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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