Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF6Q15052 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF6Q15052 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms