Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A1Q14973 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A1Q14973 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms