Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms