Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS1Q14691 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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