Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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