Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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