Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
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