Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRQ13535 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRQ13535 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRQ13535 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRQ13535 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRQ13535 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRQ13535 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRQ13535 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRQ13535 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRQ13535 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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