Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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