Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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