Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
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