Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms