Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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