Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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