Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms