Protein–RNA interactions for Protein: Q12006

PFA4, Palmitoyltransferase PFA4, yeastyeast

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4Q12006 NUP188YML103C 4968 nt1.23□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 SEC3YER008C 4011 nt1.23□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 MSN5YDR335W 3675 nt1.21□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 SEC21YNL287W 2808 nt1.21□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 YGL182CYGL182C 324 nt1.21□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 GEA2YEL022W 4380 nt1.2□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 Q0143Q0143 153 nt1.2□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 snR190snR190 190 nt1.2□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 IML1YJR138W 4755 nt1.19□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.19□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 YLR041WYLR041W 321 nt1.19□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.19□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 NUP157YER105C 4176 nt1.18□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.18□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 CHS6YJL099W 2241 nt1.17□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 FYV10YIL097W 1551 nt1.17□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 TAH1YCR060W 336 nt1.16□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 HUG1YML058W-A 207 nt1.16□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 ASE1YOR058C 2658 nt1.16□□□□□ -2.22
PFA4Q12006 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.15□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 STB6YKL072W 2301 nt1.14□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 SEC8YPR055W 3198 nt1.14□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 CDC39YCR093W 6327 nt1.14□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 BUD3YCL014W 4911 nt1.13□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 STF2YGR008C 255 nt1.13□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 SIP4YJL089W 2490 nt1.12□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 YLR232WYLR232W 348 nt1.12□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 KAP120YPL125W 3099 nt1.12□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 RAD9YDR217C 3930 nt1.11□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.11□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.11□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.11□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.1□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 snR85snR85 171 nt1.09□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.09□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 YNL205CYNL205C 423 nt1.09□□□□□ -2.23
PFA4Q12006 RPM2YML091C 3609 nt1.08□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.08□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 PRP16YKR086W 3216 nt1.08□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 MYO1YHR023W 5787 nt1.07□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 QCR9YGR183C 201 nt1.07□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 SPT7YBR081C 3999 nt1.06□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.06□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.06□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.05□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 YJR029WYJR029W 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 OST4YDL232W 111 nt1.04□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.04□□□□□ -2.24
PFA4Q12006 YDR544CYDR544C 429 nt1.02□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 SOM1YEL059C-A 225 nt1.02□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 BEM3YPL115C 3387 nt1.02□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 YPR117WYPR117W 7470 nt1.01□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 snR39BsnR39B 96 nt1.01□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 YBR099CYBR099C 384 nt1□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 YSP1YHR155W 3687 nt1□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 UBP3YER151C 2739 nt0.98□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 COG6YNL041C 2520 nt0.98□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 YDL073WYDL073W 2955 nt0.97□□□□□ -2.25
PFA4Q12006 BEM2YER155C 6504 nt0.96□□□□□ -2.26
PFA4Q12006 VAM6YDL077C 3150 nt0.96□□□□□ -2.26
PFA4Q12006 YDR210WYDR210W 228 nt0.95□□□□□ -2.26
PFA4Q12006 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.95□□□□□ -2.26
PFA4Q12006 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.95□□□□□ -2.26
PFA4Q12006 NST1YNL091W 3723 nt0.95□□□□□ -2.26
PFA4Q12006 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.94□□□□□ -2.26
PFA4Q12006 ULP2YIL031W 3105 nt0.92□□□□□ -2.26
PFA4Q12006 SEC1YDR164C 2175 nt0.91□□□□□ -2.26
PFA4Q12006 GLG1YKR058W 1851 nt0.9□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.89□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 SCC2YDR180W 4482 nt0.89□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 PMP2YEL017C-A 132 nt0.88□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.86□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.86□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 PAU24YBR301W 363 nt0.85□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 BIR1YJR089W 2865 nt0.85□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.84□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.84□□□□□ -2.27
PFA4Q12006 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.83□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 NNF2YGR089W 2811 nt0.82□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 DOP1YDR141C 5097 nt0.82□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 RKR1YMR247C 4689 nt0.81□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 LTE1YAL024C 4308 nt0.81□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 snR61snR61 90 nt0.81□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 TFB5YDR079C-A 219 nt0.81□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 PAU12YGR294W 363 nt0.79□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 YNL266WYNL266W 420 nt0.79□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 YMR326CYMR326C 309 nt0.78□□□□□ -2.28
PFA4Q12006 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.76□□□□□ -2.29
PFA4Q12006 RCO1YMR075W 2055 nt0.76□□□□□ -2.29
PFA4Q12006 CSE1YGL238W 2883 nt0.75□□□□□ -2.29
PFA4Q12006 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.75□□□□□ -2.29
PFA4Q12006 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.75□□□□□ -2.29
PFA4Q12006 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.75□□□□□ -2.29
PFA4Q12006 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
PFA4Q12006 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
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