Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms