Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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