Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms