Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms