Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms