Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB3Q04118 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms