Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC4Q03721 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms