Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms