Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms