Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms