Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PFKPQ01813 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PFKPQ01813 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms