Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5Q00535 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms