Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC5Q00444 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms