Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms