Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMF1P82094 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMF1P82094 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMF1P82094 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMF1P82094 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMF1P82094 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMF1P82094 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMF1P82094 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMF1P82094 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMF1P82094 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMF1P82094 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms