Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL7P80098 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL7P80098 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL7P80098 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL7P80098 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL7P80098 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL7P80098 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL7P80098 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL7P80098 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms