Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms