Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP1P63208 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP1P63208 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP1P63208 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms