Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms