Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP4P57796 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP4P57796 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP4P57796 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP4P57796 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP4P57796 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP4P57796 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP4P57796 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP4P57796 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP4P57796 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP4P57796 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP4P57796 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP4P57796 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP4P57796 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP4P57796 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP4P57796 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP4P57796 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP4P57796 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP4P57796 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP4P57796 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP4P57796 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP4P57796 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms