Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP107P57740 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP107P57740 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP107P57740 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms