Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFDNP55196 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFDNP55196 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFDNP55196 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFDNP55196 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFDNP55196 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFDNP55196 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFDNP55196 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AFDNP55196 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFDNP55196 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFDNP55196 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFDNP55196 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFDNP55196 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFDNP55196 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFDNP55196 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFDNP55196 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFDNP55196 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFDNP55196 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFDNP55196 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFDNP55196 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFDNP55196 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFDNP55196 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFDNP55196 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms