Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAPAP54920 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAPAP54920 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAPAP54920 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAPAP54920 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAPAP54920 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NAPAP54920 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAPAP54920 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAPAP54920 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms