Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAD23BP54727 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAD23BP54727 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAD23BP54727 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RAD23BP54727 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RAD23BP54727 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23BP54727 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23BP54727 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms