Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK2P53671 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms