Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms