Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SMARCA4P51532 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms